Bercial de Zapardiel resulta un sitio privilegiado dentro de¡ marco territorial en el que se encuentra, pues dentro de su suelo se halla ubicado un yacimiento prehistórico que permite remontar su devenir histórico a tiempos remotos, lo cual no suele ser demasiado habitual en otras zonas.

Los primeros datos del lugar en el que hoy se enclava Bercial de Zapardiel provienen del periodo temporal existente entre el final del Calcolítico y los comienzos de la Edad del Bronce, unos 2.500 años a. de C.

A 821 metros al Suroeste del término y sobre una loma que discurre paralela al antiguo cauce del Zapardíel, aparece el llamado yacimiento de El Tomillar.

Se encuentra ubicado en el extremo de una loma, y así lo describe el arqueólogo J.F. Fabián García en su estudio sobre las excavaciones realizadas en el yacimiento:
Primeros pobladores de Bercial

"Se trata de un yacimiento de reducidas proporciones, ubicado en el extremo de una loma, que se alza sobre una vega de características pantanosas, a un lado configurada por el valle de/ río Zapardiel y a otro por una pequeña Cuenca encorreíca de funcionamiento invernal en años de pluviosidad normal. Fue, pues, una zona con agua abundante y pastos, donde, además la práctica de la agricultura tiene buenas posibilidades, sólo obstaculizada por la altitud, que generalmente merma los resultados en el buen terreno que estas zonas ofrecen. Agricultura y ganadería, en particular la segunda, han quedado bien patentes en las excavaciones, sobre todo la última. La presencia de la agricultura quedó atestiguada por el hallazgo de fragmentos de molinos y molederas de granito foráneo en alguna de las fosas excavadas. La abundante presencia de ovicápridos, bóbidos, y équidos, atestiguan el consumo cárnico en el yacimiento"8. Se trata de un pequeño asentamiento, cuya ubicación parece responder más a un interés de protección ambiental que a la disposición de una estructura defensiva, como parece ser la norma predominante en toda la zona. Aparece numerosa cerámica de buena calidad y excelente conservación, acompañada de industria lítica, aunque en este caso exclusivamente se limita a la utilización de lascas.

Cuenco de cerámica fabricado a mano, hallado en la necrópolis Almeriense de los Millares; es una pieza característica de la cultura que se desarrolló en la primera edad del Bronce, junto con el fenómeno del megalitismo, entre 2.500 y 2.200 años a de Cristo

Acompaña el conjunto una serie de inhumaciones, hecho menos habitual en el resto de yacimientos pertenecientes al mismo periodo Calcolítico.

Todos estos rasgos hacen presuponer a los arqueólogos que el yacimiento encontrado en Bercial de Zapardiel se puede ubicar en el periodo de transición entre el Calcolítico y el Bronce Antiguo, puesto que presenta importantes componentes calcolíticos con ciertas degradaciones que anuncian la evolución al periodo siguiente. Por todo ellos nos hallaríamos ante restos pertenecientes a lo que algunos autores consideran el Cobre Tardío/Final, ampliamente justificado tanto por los hallazgos encontrados como por la datación efectuada a través del Carbono-14-10